转学生秦屿发现班主任江临风每夜在空教室独自授课，黑板上写满发光的文字。他偷偷潜入后，被卷入“秘密课堂”——一个能让人重温遗憾记忆的异度空间。江临风告诉他，自己是在用这种能力超度亡魂。秦屿在一次次课堂中，逐渐窥见江临风深藏的孤独与深情，两人在亦师亦友的关系中彼此救赎。
秘密课堂即将崩塌，江临风决定留下来陪那些未完成执念的灵魂。秦屿冲进课堂抱住他，说“我陪你一起”，两人用爱化解了所有遗憾。
秦屿在课堂中看到江临风的记忆：他曾是战地医生，未能救回恋人，因此创造出秘密课堂为自己赎罪。秦屿心疼不已，主动走进他的世界。
一位因车祸去世的少年亡魂出现在课堂，希望秦屿帮忙传话给家人。秦屿冒雨去少年家送信，回来后江临风给了他一个拥抱。
秦屿假装离开学校，半夜返回发现江临风正在授课。他悄悄听课，被江临风抓个正着，江临风没有赶他走，反而邀他当助手。
秦屿因父母离婚转学，心情低落。在走廊撞见江临风，江临风对他微笑说“欢迎来到我的班级”，秦屿感到莫名安心。
秦屿夜晚路过教学楼，看到空教室里透出奇异蓝光，好奇推门而入，看到江临风在黑板上写满陌生符号，周围漂浮着无数光点。